Projekt Voda pro Prahu je komplexní projekt, jehož hlavním cílem je zlepšit kvalitu pitné vody pro obyvatele hl. města Prahy a zároveň přispět ke zlepšení morfologického stavu a kvality vodních toků na území hl. města Prahy.

 
Hlavní cíl projektu je složen z několika konceptů:
Koncept č. 1 projektu je na příkladu vodních zdrojů, určených pro zásobování hlavního města Prahy pitnou vodu, v předstihu kvantifikovat obsahy PPCP v celém procesu úpravy vody a nastavit mechanismy jejich kontroly při různých hydrologických situacích včetně extrémních jevů. Výsledkem projektu bude vytvoření varovného systému pro pražskou vodárenskou soustavu před znečištěním mikropolutanty včetně softwaru pro predikci průtoků a koncentrací PPCP.

Koncept č. 2 je zlepšení ekologického stavu potoků na území Prahy pomocí zvýšení jejich tvarové členitosti a nabídky stanovišť pro vodní organismy. Činnosti se zaměří na vodní toky na území a ve správě hlavního města Prahy. Jako hlavní nástroj pro zlepšení morfologického stavu koryt potoků budou vyvíjeny a testovány objekty napodobující funkci přirozeného, tzv. říčního dřeva.

 
Koncept č. 3 je vypracování podrobné studie odtokových poměrů v povodí VD Želivka – Švihov. Studie navazuje na řešení projektu Strategie ochrany před negativními dopady povodní a erozními jevy přírodě blízkými opatřeními v České republice, které v zájmovém povodí vodárenské nádrže identifikovala oblasti s vysokým stupněm erozního ohrožení (cca 130 km2).

 
Koncept č. 4 je stanovení a zhodnocení změny jakosti vody ve Vltavě během průtoku městem, včetně vlivů lokálních vodotečí a zdrojů znečištění a také změny hydromorfologických charakteristik. Výstupem bude zhodnocení významnosti jednotlivých antropogenních tlaků za různých situací (sezónní cyklus, povodeň, sucho) a zpracování provozního modelu umožňujícího predikci změn jakosti vody a optimalizaci tlaků. Výstup podporuje dlouhodobé plány na využití Vltavy v intravilánu Prahy.